比較而言，在Morris水迷宮中，小鼠（C57BL/6株）的成績(jī)沒(méi)有大鼠好（Long-Evans株）[40,41]。這并不是因?yàn)樾∈蟮目臻g學(xué)習(xí)記憶能力差，而是在游泳池內(nèi)小鼠的空間學(xué)習(xí)能力可能受到某些非空間因素的阻礙，如游泳的路徑不直，游泳時(shí)昂頭更劇[41]。為此，有人認(rèn)為[41]：a. 在以水為基礎(chǔ)的任務(wù)中，不要將小鼠的成績(jī)與大鼠的成績(jī)匹配，否則會(huì)引起混淆。但是，如果熟知了任務(wù)的局限性，該任務(wù)還是可用于小鼠的檢測(cè)；b. 在陸地任務(wù)中，尤其是動(dòng)物的運(yùn)動(dòng)性受到臂的限制的任務(wù)中，小鼠的成績(jī)應(yīng)該與大鼠的成績(jī)匹配；c. 小鼠表現(xiàn)出的可以和大鼠比較的行為值得進(jìn)一步研究，因?yàn)樵摬町愑兄诶斫庠诳臻g行為中所使用的種屬特異性策略的不同。

就小鼠而言，在Morris水迷宮中不同株的小鼠的學(xué)習(xí)記憶成績(jī)差異巨大。例如，C57BL/6J、CD-1和DBA/2小鼠是優(yōu)良的學(xué)習(xí)者，而B(niǎo)ALB/c小鼠不能學(xué)會(huì)該任務(wù)。所以，事先要對(duì)自己所用的小鼠是否適合于Morris水迷宮檢測(cè)進(jìn)行評(píng)價(jià)。但各株在Morris水迷宮中學(xué)習(xí)成績(jī)的好壞可能是相對(duì)的，要視所使用的程序而定。例如在C57BL/6J和129T2/Sv株小鼠間，在標(biāo)準(zhǔn)的空間參考記憶程序中（試驗(yàn)期平臺(tái)的位置恒定），兩株有同樣好的成績(jī)，但在逐步式學(xué)習(xí)程序中，C57BL/6J株在各學(xué)習(xí)階段內(nèi)的成績(jī)都比129T2/Sv株差，而在集中空間學(xué)習(xí)程序中（平臺(tái)的位置每天改變），C57BL/6J株的成績(jī)又要好于129T2/Sv株[34a]。

對(duì)于水池的大小，Morris初（1981年）用于大鼠的水池是直徑1.32米、高為0.6米，但后來(lái)（1984年）改為直徑2.14米 、高0.4米[7a]。對(duì)于小鼠的實(shí)驗(yàn)水池，文獻(xiàn)中介紹的迷宮直徑差異巨大，小到0.6米, 大到2.0米[34]。一般而言，過(guò)小的水池使小鼠爬上平臺(tái)的偶然性增加，任務(wù)難度減小。

Morris水迷宮用于大鼠的水溫為26 ± 1℃[7a]，但用于小鼠的水溫一般較低（18~22℃[66]）。近年來(lái)，文獻(xiàn)中提及的水溫有逐漸增加的趨勢(shì)，一些已達(dá)到25℃[40]或26℃[11]甚至28℃。但過(guò)高的水溫容易使小鼠產(chǎn)生漂?。╢loating）而不急于游泳來(lái)尋找平臺(tái)，至少對(duì)某些株是這樣，如昆明小鼠和SAM小鼠。不過(guò)，過(guò)低的水溫又可使小鼠體溫喪失過(guò)快而對(duì)健康有害。我們對(duì)青年昆明小鼠進(jìn)行了水溫對(duì)迷宮成績(jī)影響的觀(guān)察，結(jié)果發(fā)現(xiàn)27~28℃組的小鼠成績(jī)差，而17~18℃組和21~22℃組小鼠的學(xué)習(xí)成績(jī)沒(méi)有區(qū)別，所以，我們推薦的水迷宮實(shí)驗(yàn)用21~22℃水。